Rui Roque é licenciado em Engenharia Naval pelo Instituto Superior Técnico (IST), tendo ainda no currículo o curso de “Modernas Técnicas de Gestão e Administração de Empresas para Engenheiros”; “Engenharia Oceânica” e o curso de “Submarinos, Projecto de Estruturas”, todos do IST.
Da sua experiência profissional constam funções como sócio fundador da empresa Sociedade de Projectos Navais, formador e docente na Universidade do Algarve. Foi, ainda, sócio-gerente de várias empresas ligadas ao setor marítimo e é, atualmente, sócio-gerente da empresa Nautiber Estaleiros Navais do Guadiana desde 1992.